본 발명은 컴퓨터 모니터 상에서 인지기능을 평가하기 위해 주어진 과제(순서 맞추는 과제)를 수행할 때, 지시사항에 맞게 화면에 나타나는 움직이는 물체를 주시한 피검자의 안구 운동에 관한 데이터와 과제 수행 중 동시에 측정되는 자율신경반응에 관한 데이터의 변화를 통해, 인지기능 저하의 유무를 판단하고자 하는 인지기능을 평가하는 안구운동 및 자율신경반응 분석을 통한 경도인지장애 선별 방법에 관한 것으로, 본 발명에 따른 안구운동 및 자율신경반응 분석을 통한 경도인지장애 선별 시스템은 관리자 단말 및 피검자 단말을 포함하는 단말, 상기 단말과 연결된 치매 판별 서버, 및 상기 단말과 상기 치매 판별 서버를 연결하기 위한 통신망을 포함하는 안구운동 및 자율신경반응 분석을 통한 경도인지장애 선별 시스템으로서, 상기 치매 판별 서버는, 기호잇기검사, 정방향(Pro-), 역방향(Anti-), 및 신속보기(Saccade) 과제, 및 추시(smooth pursuit)과제를 전산화한 인지평가 컨텐츠부; 피검자가 과제를 수행할 때 상기 피검자 단말의 카메라부에 의해 전송된 안구운동에 관한 데이터, 및 상기 피검자가 과제를 수행할 때 상기 피검자 단말의 센서부에 의해 전송된 자율신경반응에 관한 데이터를 수집하기 위한 인지평가 데이터 수집부; 및 상기 인지평가 데이터 수집부에 의해 수집된 데이터를 분석하여 인지기능을 평가하는 인지평가 분석부를 포함한다.