본 발명은 미선나무(Abeliophyllumdistichum) 에탄올 추출물의 헥센 분획물을 유효성분으로 함유하는 항혈전 조성물에 관한 것으로서, 보다 상세하게는, 미선나무의 잎과 줄기로부터 조제된 에탄올 추출물의 헥센 분획물을 유효성분으로 함유하는 혈액 응고 저해를 통한 혈전증의 예방 또는 치료/개선용 약학적 조성물 및 건강 기능 식품에 관한 것이다. 본 발명의 혈전증의 예방 또는 치료용 약학적 조성물 및 건강 기능 식품의 유효성분으로서의 미선나무 에탄올 추출물의 헥센 분획물은, 본 명세서의 실시예를 통해 증명된 바와 같이, 혈전 생성 관련 효소 저해 및 혈액 응고 인자의 저해에 의한 강력한 항혈전 활성을 나타냄과 동시에, 열 안정성이 우수하고, pH 2의 산성 조건 및 혈장 내에서도 혈전 생성 관련 효소 및 혈액 응고 인자 저해 효과의 손실이 나타나지 않으므로, 혈행 개선을 통해 허혈성 뇌졸중 및 출혈성 뇌졸중과 같은 혈전증의 예방 및 치료용으로 사용할 수 있을 것으로 기대되며, 상기 유효성분은 추출액, 분말, 환, 정 등의 다양한 형태로 가공되어 상시 복용이 가능한 형태로 조제할 수 있는 뛰어난 효과가 있으므로 제약 산업 및 식품 산업상 매우 유용한 발명인 것이다.